Tak jako je improvizace nedílnou součástí hudby jazzové, je objevování starých pramenů a rozšiřování našich znalostí o historických praktikách provozování hudby zásadní pro každého seriózního interpreta staré hudby. Jan Čižmář se aktivně věnuje výzkumu v archivech, objevováním zapomenutých děl a jejich uváděním do života na koncertních i divadelních pódiích.